ここでは、ＣａＬｉｔ２で開発されたソフトウェアを使って、研究者の部屋の壁いっぱいのサイズのディスプレイに、患者の腸内細菌や、バイオマーカーなどのデータを映し出す試みが行われている。その狙いは、巨大なディスプレイに表示されることで、健康な人と疾患のある人の腸内細菌の違いを視覚的に比較したり、相関関係を見つけたり、将来の研究を推し進める仮説を導き出したりすることにある。
サンディエゴ校では、サンフランシスコに拠点を置く建築設計事務所ＮＢＢＪが、ＣａＬｉｔ２の要望を踏まえて、六階建て、グロス面積およそ23,000㎡の研究棟（のちの「アトキンソンホール」）を設計した。内部は壁や部屋が少ない開放的な空間で、研究者たちがスペースを共有できた。オフィスの備品は、様々な人数のチームに合わせて、自由自在に移動できるものが選ばれた。アーバイン校のキャンパスにも同様の研究棟が作られた。
ＣａＬｉｔ２は、プロジェクトの参加者に研究や実験のスペースを提供したが、研究者や部門にひとつのスペースが永続的に割り当てられることはなかった。ＣａＬｉｔ２は様々な部門の研究者が集まるプロジェクトの拠点（ハブ）として設立された機関だった。研究者たちは、無菌室やフォトニクス（光子）の実験室など、専門的な設備も共有できる。
そのような共有スペースを築くことは必ずしも容易ではなかったし、大学では一般的でもなかった。例えば、サンディエゴ校の無菌室「ナノスリー」は、ナノスケール研究では同校ではじめての共有設備で、三分野（ナノ科学、ナノ工学、ナノ医療）が共同で利用した。「ＣａＬｉｔ２のサンディエゴ部門にとって、ナノスリーの設置は文化的な一大進歩でした」とスマーは言う。
「この設置をめぐっては、ＣａＬｉｔ２の首脳陣が学内の古い文化を打破しなくてはなりませんでした。無菌室はそれまで研究者や学部単位で、別々に利用されるのが慣例になっていたからです。サンディエゴ校の部長はその慣例に逆らって、研究者たちに設備を共有するように呼びかけました」。その結果誕生したのが、部門ごとに自前で持つよりはるかに設備の充実した実験室だった。この実験室は、交流やコラボレーションを促進し、コミュニティー意識を育むうえで役に立った。